从文昌宫沿游道东行约150米，便至灵宫殿，灵宫殿在巍山当地又被俗称为“主君阁”。

　　灵宫是道教特有的护法神，相传宋朝人王善成仙后，被封为一尊专司天上和人间的纠察的神，地位类似于佛寺中的韦陀。一般道观里，灵宫只设于侧殿或大门口，而巍宝山则让灵官独主一座殿宇，可以说是巍宝山的独特处。

　　而你走出灵宫殿，又会发现其正后方就是供奉玉皇大帝的玉皇阁，如果把“灵宫殿”看成是为“玉皇阁”守持法门，又觉理所当然了。

　　灵官殿始建于明末清初，清末毁于兵焚，光绪年间又重建。现在的灵官殿有大门、正殿和两边厢房等建筑。

　　大门相似于文昌官大门，为三跨斗拱木牌坊式建筑，檐角略平，两侧门为方门；大殿塑奉灵官像，赤面三日，手举钢鞭，正气凛然。

　　灵宫内最有名气的“宝贝”是大殿前的一株明代古山茶，为“九心十八瓣”茶花(和丽江“万朵山茶”为同一个品种)。丽江“万朵山茶”以“多”而闻名，此株古山茶却以“高”而著名，茶树高达17米，笔直树冠直撑蓝天，就像一柄长把“花伞”遮盖住灵官殿庭院，树之高据考为世界茶花树之最。

　　为看这株世界之最的茶花，最好选择春节后的一个月间到巍宝山旅游，此时茶花刚放，可以看到一柄巨大的“花伞”的奇观。如能以诚心获得观内道土的许可，可以采走一朵古山茶花，更是莫大的福份与运气，据说古山茶的数百年“精气”，可以养心治病。

　　在灵官殿东侧，是太子殿，塑奉释迎太子。

　　太子殿初建于清代，为一独殿,“文革”中遭毁，90年代才重建修复。虽刚刚重建，但因释迎太子掌管人间生育，因而此殿香火甚旺。